Analiza Sekwencji DNA
Oferowane usługi:
- Składanie dłuższych sekwencji z pojedynczych odczytów. Tworzenie pojedynczych kontigów.
- Dobór starterów i warunków do wykonania reakcji PCR i sekwencjonowania.
- Analiza restrykcyjna fragmentów DNA, wykonanie map restrykcyjnych.
- Poszukiwanie otwartych ramek odczytu i ich analiza; wyszukiwanie motywów białkowych, sygnałów lokalizacji komórkowej.
- Poszukiwanie sekwencji homologicznych i tworzenie drzew filogenetycznych.
- Analiza mutacji, porównanie sekwencji z sekwencją wzorcową.
Użyteczne Linki:
- Align two sequences using BLAST (bl2seq)
- Nucleotide blast
- Oligo Calc: Oligonucleotide Properties Calculator
- Reverse Complement
- Pick primers from a DNA sequence : Primer 3.0
- UCSC In-Silico PCR