Usługi Sekwencjonowania NGS 
Sekwencjonowanie całego genomu po reakcji z wodorosiarczynem
Informacje ogólne:
Sekwencjonowanie całego genomu (WGBS – Whole Genome Bisulfite Sequencing) po reakcji z wodorosiarczynem jest skuteczną techniką badania metylacji DNA. WGBS łączy traktowanie DNA wodorosiarczynem i sekwencjonowanie wysokoprzepustowe co pozwala na wygenerowanie metylomu o dużej dokładności i przeprowadznie bezbłędnej analizy w skali genomowej. Technologia WGBS może być stosowana w badaniach epigenetycznych włączając w to badania rozwoju embrionalnego, różnicowania i podobieństwa komórek, przeistaczania komórek macierzystych w komórki dorosłe oraz odpowiedzi komórek na sygnały środowiskowe (hormony, odżywki, stres, uszkodzenia).:
Możliwości, korzyści:
- Dokładna analiza wzorców metylacji dla każdej cytozyny
- Wygenerowanie kompletnej mapy metylomu dla każdego organizmu
- Złoty standard w analizie metylacji DNA
Analiza bioinformatyczna:
- mapowanie do genomu referencyjnego (wydajność mapowania, stopień duplikacji, głębokość sekwencjonowania, pokrycie genomu odczytami)
- wykrywanie metylacji
- obliczanie poziomu metylacji
- wykrywanie miejsc metylowanych w odmienny sposób (DMS) w tym regionów o zróżnicowanej metylacji (DMR) oraz wykrywanie i annotacja odmiennie zmetylowanych promotorów (DMP)
- interpretacja funkcjonalna wyników oparta na ontologii genów i ścieżkach KEGG dla genów związanych z DMR i genów związanych z DMP
- graficzne przedstawienie (wizualizacja) wyników
Parametry techniczne - wymagania dotyczące próbek:
Zalecana ilość danych do analizy:
|
