JAK PRZYGOTOWAĆ MATRYCE?
Próbki przysyłane do sekwencjonowania powinny zawierać:
-
Starter: w stężeniu 5 pmol/µl (5 µM), co najmniej 10 µl.
W przypadku stosowania starterów standardowych, Genomed bezpłatnie dostarcza wybrany starter
-
Ilość DNA zawieszona w wodzie, w objętości nie mniejszej niż 12 µl (minimum) na zlecenie jednego sekwencjonowania:
produkt PCR < 500 pz 60 ng produkt PCR 500-1000 pz 120 ng produkt PCR > 1000 pz 240 ng DNA jednoniciowy 60-120 ng DNA dwuniciowy, plazmid 240-600 ng cosmid, BAC 600-1200 ng -
Stężenie DNA zawieszonego w wodzie, w objętości nie mniejszej niż 12 µl (minimum) na zlecenie jednego sekwencjonowania:
produkt PCR < 500 pz 5 ng/µl produkt PCR 500-1000 pz 10 ng/µl produkt PCR > 1000 pz 20 ng/µl DNA jednoniciowy 5-10 ng/µl DNA dwuniciowy, plazmid 20-50 ng/µl cosmid, BAC 50-100 ng/µl
Produkty PCR oddawane jako matryce do sekwencjonowania powinny zostać oczyszczone ze starterów, dNTP-ów, etc. i zawieszone w wodzie.
- Zdjęcie żelu matrycowego DNA
- Wypełniony formularz do opisu próbek
JAK OPISAĆ MATRYCE?
Zachęcamy do opisywania próbek on-line - 5% rabatu !!!
Internetowy formularz opisu
próbek gwarantuje, ze nazwy Państwa próbek będą nazwane poprawnie.
Bardzo prosimy o dołączenie opisu dostarczanych próbek, zawierającego:
- nazwę każdej próbki,
- stężenie matrycy lub zdjęcie żelu wraz z informacją ile mikrolitrów naniesiono na żel
- jakiej wielkości jest produktu PCR lub plazmid
- jaką metodę użyto do izolacji DNA
- nazwę startera
- temperaturę annealingu (Tm) startera.
- w przypadku produktów PCR - czy produkt został oczyszczony po reakcji PCR, czy też wymaga oczyszczania
Opis powinien być opatrzony nazwiskiem / instytucją zamawiającego oraz
nazwą użytkownika
(loginem) z serwisu internetowego Genomedu.
| przejdź do formularza opisu próbek (próbki opisane online - 5% rabatu) lub pobierz formularz do opisu próbek: (pdf) (xls) |
W przypadku przesyłania płytek z przygotowanymi reakcjami lub matrycami prosimy o wypełnienie formularza do opisu płytki , lub przesłanie emailem Adres poczty elektronicznej jest chroniony przed robotami spamującymi. W przeglądarce musi być włączona obsługa JavaScript, żeby go zobaczyć. opisu w formacie csv (Excel)
Próbki można wysyłać na koszt Genomedu korzystając z kuriera: WARSZAWA Kurier Genomedu tel. kom. 513 445 549 KRAJ : kurier UPS Link do strony internetowej do zamawiania kuriera: https://row.ups.com/GuestAccess/Guest/Entry?Company=be7c6dd7-a790-4ff6-846d-14b1acbd3aea Przed zamówieniem kuriera UPS prosimy przeczytać poniższą instrukcje. Instrukcja zamawiania kuriera UPS KRAJ : kurier DHL
Link do strony internetowej do zamawiania kuriera:
|
- Genomed pokrywa koszty przesyłki standardowej (koperty o wadze do 300g, odbiór i nadanie w dni robocze. Nie pokrywamy kosztów usług dodatkowych: Prearranged Delivery, Cash on Delivery, Ubezpieczenie, Priority, Return Document, Saturday Delivery.
- Zalecamy stosowanie kopert z bąbelkami.
- Matryce DNA (produkty PCR, plazmidy) i primery w stężeniu 5µM są stabilne w temperaturze pokojowej przez kilka dni. Jeśli życzą sobie Państwo przysłać próbki z wkładami chłodzącymi - doliczamy różnicę w cenie przesyłki.
- Nadając próbki do sekwencjonowania jako zawartość prosimy podawać: "materiał DNA bezpieczny w transporcie".
- Optymalna długość startera to 17-25 nt.
- Zdegenerowane startery nie są polecane, aczkolwiek dopuszcza się takie, jeśli ostatnich 8 nukleotydów (3' koniec) jest komplementarnych.
- Temperatura topnienia startera powinna wynosić od 45-60 °C. Przy czym optymalne odczyty uzyskuje się przy temperaturze 52-55 °C.
- Wykonanie reakcji jest utrudnione a nawet może być niewykonalne, jeśli starter tworzy struktury typu szpilki do włosów (hairpin) lub homodimery.
Przed podjęciem decyzji o sekwencjonowaniu zalecamy sprawdzić wybrany starter np.
tutaj
.
W przypadku stosowania
starterów standardowych
, Genomed bezpłatnie dostarcza wybrany starter.